Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd1Q99MV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tdrd1Q99MV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms