Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc1Q99MR8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mccc1Q99MR8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms