Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PccbQ99MN9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PccbQ99MN9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms