Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atp1b4Q99ME6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms