Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smtnl1Q99LM3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smtnl1Q99LM3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smtnl1Q99LM3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms