Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds2Q99L43 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds2Q99L43 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms