Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pagr1aQ99L02 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms