Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clint1Q99KN9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms