Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Reep3Q99KK1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Reep3Q99KK1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms