Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn2aQ99KJ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2aQ99KJ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms