Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GatbQ99JT1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GatbQ99JT1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms