Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Def8Q99J78 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Def8Q99J78 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Def8Q99J78 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Def8Q99J78 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Def8Q99J78 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms