Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc33a1Q99J27 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc33a1Q99J27 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc33a1Q99J27 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc33a1Q99J27 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc33a1Q99J27 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc33a1Q99J27 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc33a1Q99J27 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc33a1Q99J27 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms