Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn16Q925N4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn16Q925N4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn16Q925N4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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