Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Med1Q925J9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Med1Q925J9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms