Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms