Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn1Q922Y1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms