Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Traf7Q922B6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf7Q922B6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms