Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg3l1Q920A7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms