Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slc5a4bQ91ZP4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms