Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PccaQ91ZA3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PccaQ91ZA3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms