Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms