Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1bQ91YK2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1bQ91YK2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1bQ91YK2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms