Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx4Q91YJ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx4Q91YJ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms