Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha7Q91Y13 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdha7Q91Y13 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms