Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms