Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp9Q91WM3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp9Q91WM3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms