Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csde1Q91W50 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csde1Q91W50 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms