Protein–RNA interactions for Protein: Q91VY6

Cytip, Cytohesin-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CytipQ91VY6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CytipQ91VY6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CytipQ91VY6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CytipQ91VY6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms