Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hps3Q91VB4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hps3Q91VB4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms