Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd248Q91V98 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd248Q91V98 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms