Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc71Q8VEG0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc71Q8VEG0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms