Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc115Q8VE99 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc115Q8VE99 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc115Q8VE99 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc115Q8VE99 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc115Q8VE99 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc115Q8VE99 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc115Q8VE99 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc115Q8VE99 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc115Q8VE99 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms