Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Washc1Q8VDD8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Washc1Q8VDD8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Washc1Q8VDD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms