Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh10Q8VCH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh10Q8VCH7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms