Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SdsQ8VBT2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SdsQ8VBT2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SdsQ8VBT2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms