Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1mtQ8R4U6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1mtQ8R4U6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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