Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy2Q8R4C2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms