Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaaf4Q8R368 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dnaaf4Q8R368 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnaaf4Q8R368 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms