Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip5Q8R361 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms