Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup58Q8R332 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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