Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5Q8R2T8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms