Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sumf1Q8R0F3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sumf1Q8R0F3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sumf1Q8R0F3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms