Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b4Q8QZY9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms