Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Colec12Q8K4Q8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colec12Q8K4Q8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colec12Q8K4Q8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms