Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pof1bQ8K4L4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pof1bQ8K4L4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pof1bQ8K4L4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms