Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncapd2Q8K2Z4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd2Q8K2Z4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd2Q8K2Z4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms