Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prpf39Q8K2Z2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms