Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stn1Q8K2X3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stn1Q8K2X3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms