Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc12Q8K2L8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms